1、基肥
一般含钼工业废渣适宜于作基肥或种肥。通常将钼肥或含钼工业废渣与普通过磷酸钙加工成含钼过磷酸钙使用。因为磷和钼对作物有吸收有相互促进作用，混合施用有利于提高钼肥的肥效。
2、种子处理
拌种时每公斤种子用钼酸钠1-3克；浸种时可用0.05-0.1%的钼酸铵溶液浸种12小时。
3、根外追肥
一般常用0.01-0.1%的钼酸铵溶液，对作物进行喷施。从苗期到开始现蕾的这段时间内，可喷施钼肥1-2次。
钼肥还可加到常量元素肥料中混用，但不能与酸性化肥混合施用，否则会导致溶解度下降。经钼肥处理过的种子，人畜不能食用，否则会引起钼中毒。
